U sklopu Zavoda za gastroenterologiju i hepatologiju djeluju: Ambulanta za hepatologiju Ambulanta za nasljedne bolesti jetre i gastroenterologiju Ambulanta za funkcijske bolesti Ambulanta za upalne bolesti crijeva Ambulanta za upalne bolesti crijeva i celijakiju odraslih Ambulanta za upalne bolesti crijeva i kliničku prehranu Ambulanta za gastroenterološku endoskopiju Ambulanta za pankreatično-bilijarne bolesti Ambulanta za gastroenterologiju Naručivanje pacijenata Za endoskopske pretrage bolesnici se naručuju isključivo nakon pregleda u specijalističkim ambulantama KBC-a Zagreb ili nakon uvida u medicinsku dokumentaciju koja opravdava indikaciju za pojedinu endoskopsku pretragu i putem e-naručivanja od strane liječnika opće medicine uz kratku epikrizu.